526互联

每日学习记录20230220_tibble gseDO and limma

发布时间 2023-04-11 08:53:01作者: Mo槑

20230220:tibble gseDO and limma

  1. R的tibble格式数据需要转成dataframe才能去除格式,得到某一列纯粹的数据

  2. gseDO是DOSE包里面的函数,用于 Disease Ontology (DO) 分析和富集分析

  3. Q：为什么将FPKM转换为TPM去做转录组差异分析？
    A：只有转换成TPM才勉强可以用limma做差异分析；而DESeq2和edgeR是对count数据进行差异分析