精神分裂症 分裂症 基因 科研
宏基因组：KenKra2 注释”真菌“（自整理，详细，全网唯一 ）
(Newbase) [wz@localhost ~]$ kraken2-build -h Usage: kraken2-build [task option] [options] Task options (exactly one must be selected): --download-taxo ......
【工作01】某科研院所 - 3500每月 - offer - 拒
经历 导师推荐的一家单位。 跟我说的好听。说什么就开始的半年（6个月实习期）难捱，之后每个月工资（底薪 + 绩效）比学校发给他的还高。 这里需要先说明一下我所在大学的教师工资。经历过一次工资发放改革，现在绩效平摊到了每一个月里，他一个月的工资到手大概是9000左右，五险一金等另算。 我和他一再确认， ......
植物基因组学和作物改良中的深度学习
目录深度学习：概念、工具和注意事项沿着分子生物学的中心法则进行深度学习DNA和基因特性蛋白质特性模型和数据共享理解基因组变异：从关联到因果关系和分子机制深度学习育种4.0：编辑育种结论 植物基因组学取得了巨大进步，其特点是高通量技术的爆炸式增长，以低成本识别多维全基因组分子表型。更重要的是，基因组学 ......
植物图形泛基因组Graph-based pan-genome
目录图形泛基因组的构建图泛构建方法获取和合并PAV变异图泛的存储格式线性参考基因组坐标的恢复图泛的可视化图泛的注释基因结构注释图泛的变异注释结构变异鉴定与基因分型图泛比对软件的优势图泛的应用功能元件的鉴定现有物种中的图泛规模基于图泛的GWAS未来应用结论与未来展望 图形泛基因组（图泛）以节点和路径的 ......
小猫人格分裂研究报告
小猫人格分裂研究报告 经观察，小猫可能具有一定人格分裂现象，为此我进行了调查和研究。 小猫新人格产生的机理 小猫新人格的产生是对环境主动适应的结果，如果小猫察觉到自己的人格与环境的不适应性，那么他会对人格进行修改，如果不适应性十分严重他会直接生成一个新人格。 研究表明，镣铐加厚的时候往往是新人格产生 ......
公司在职第四党支部开展 “传承红色基因，发扬两弹精神”主题党日活动，金刚石刀具
成都工具研究所有限公司的前身是成都工具研究所，于1956年创建于北京，是原机械工业部的直属研究所，是我国机械工业的综合性工具科研机构。公司官网：http://www.ctri.com.cn/公司主要从事精密切削工具、精密测量仪器以及表面改性处理技术的技术研究、产品开发和应用服务。 2020年9月5日 ......
易基因：RRBS等揭示DNA甲基化-肿瘤免疫逃逸-肾上腺皮质癌侵袭的相关性｜表观研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 肾上腺皮质癌（Adrenocortical carcinoma，ACC）是一种罕见的侵袭性肾上腺内分泌癌。在肾上腺皮质癌中，最近研究表明以CpG岛甲基化表型(CpG island methylator phenotype，CIMP)为特 ......
宏基因组测序流程及其分析步骤
测序样本信息：完成了70个根际土壤样本的宏基因组测序。 数据预处理： 使用KneadData工具进行质控和去宿主处理。 利用Trimmomatic去除接头序列并进行质量过滤。 使用Bowtie2构建宿主库和进行去宿主处理。 从头组装：采用MEGAHIT工具对原始测序数据进行从头组装，生成contig ......
基因组选择GS应用的四个场景
目录GS应用的四个场景情景1情景2情景3情景4 本文整理自Giovanny E Covarrubias Pazaran博士的报告《Genomic Selection in R》，他是国际水稻研究所植物育种和遗传学博士，具有强大的统计学背景以及具有从事育种计划和实践研究的丰富经验，是R和SAS等不同软 ......
根据Accession id下载NCBI基因组
usage： 脚本就不注释了，会perl的都看得懂；测试了下，速度感人OTZ，淦！ #!/usr/bin/env perl use strict; use warnings; use Cwd qw/getcwd/; use Getopt::Long; use Net::FTP; use featur ......
易基因：ChIP-seq等揭示BRWD3调控KDM5活性以维持H3K4甲基化水平的表观机制｜PNAS
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 组蛋白修饰对调控染色质结构和基因表达至关重要，组蛋白修饰失调可能导致疾病状态和癌症。染色质结合蛋白BRWD3（Bromodomain and WD repeat-containing protein 3）是Cul4-DDB1 E3泛素连 ......
Qt之分裂器(QSplitter)
一、QSplitter概述 QSplitter 是 Qt 中的一个布局管理器，允许用户在应用程序窗口中创建可拖动的分隔器，以便调整多个子窗口或控件的大小。它是一种非常有用的布局管理器，用于创建可分隔的多个部分，通常用于分割、重新排列和管理用户界面中的多个区域。 以下是有关 QSplitter 的详细 ......
易基因： WGBS等从DNA甲基化揭示杀鲑气单胞菌灭活疫苗对大菱鲆的免疫力：抗性育种
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化是表观遗传学中最重要的修饰之一，在免疫应答中发挥着重要作用。自引进大菱鲆（Scophthalmus maximus，商品名：多宝鱼）以来，养殖规模不断扩大，其间各种细菌、病毒和寄生虫引起的疾病日益严重。因此，灭活疫苗以其独特 ......
易基因：番茄细菌性青枯病的噬菌体联合治疗｜国人佳作
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 生物防治是利用细菌接种剂来改变植物根际微生物群落的组成，但在以往研究中存在有接种的细菌在根际建立不良，与本地微生物组争夺资源，干扰本地微生物的问题。而与细菌接种剂相比，噬菌体的主要好处是它们的宿主特异性，和只要有宿主细菌存在，即便是在其 ......
薪火相传经验谈——如何做科研
闫杰熹：沟通，让科研变得美好 与自己沟通，与导师沟通 潘玲：我在科研中的苦与乐 跳出舒适圈，探索不熟悉的方向 找到有意义的研究问题 坚持，自信 用slice或者word把这段时间的工作或者思考清晰地写下来 游凯超：我的科研经历与科研习惯 袁粒：读博不易，且读且珍惜 ......
工业毛刷厂家,成都工具研究所有限公司组织开展《科研项目管理办法》和《新产品管理办法》 学习宣贯活动
成都工具研究所有限公司的前身是成都工具研究所，于1956年创建于北京，是原机械工业部的直属研究所，是我国机械工业的综合性工具科研机构。公司官网：http://www.ctri.com.cn/公司主要从事精密切削工具、精密测量仪器以及表面改性处理技术的技术研究、产品开发和应用服务。 经修订《科研项目办 ......
易基因：WGBS等揭示植物基因体动态DNA甲基化与基因表达可塑性相关｜Genome Biol
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在一些真核生物中，DNA甲基化发生在基因编码区，称为基因体甲基化(gene body methylation，GbM)。尽管DNA甲基化在转座子和重复DNA沉默中的作用已得到很好的表征，但基因体甲基化与转录抑制无关，其生物学重要性尚不清 ......
易基因：细菌微生物基因表达调控表观研究方案｜原核三代甲基化+转录组
1、原核甲基化 原核生物中的DNA甲基化 原核生物甲基化为什么基于三代测序？ 第三代DNA测序为原核细菌的甲基化和表观遗传的研究开辟了一条新的途径，能够在基因组的水平上获取整个表观遗传的序列信息，绘制全基因组甲基化组。 细菌中DNA甲基化研究意义 Matthew J. Blow等人通过对200多种不 ......
易基因：细菌微生物基因表达调控表观研究方案 | 原核三代甲基化+转录组
1、原核甲基化 原核生物中的DNA甲基化 原核生物甲基化为什么基于三代测序？ 第三代DNA测序为原核细菌的甲基化和表观遗传的研究开辟了一条新的途径，能够在基因组的水平上获取整个表观遗传的序列信息，绘制全基因组甲基化组。 细菌中DNA甲基化研究意义 Matthew J. Blow等人通过对200多种不 ......
【生活00】物质生活的贫乏会导致精神的贫乏吧
芜湖神山公园招聘会 网上找的招聘会相关的新闻链接 千元补贴 正如上面的网址说的，去参加招聘会的大学生会给予1000元的面试补贴。 实验室的大家决定组团去。 我不想去的。 可为了所谓的“合群”，最后还是决定一起去了。 因为最后他们回来肯定又会说一大堆的“你没去要后悔了”，“我们每个人都拿了多少多少钱， ......
基于深度学习框架的基因组预测新模型SoyDNGP
目录简介材料方法数据集SoyDNGP的模型结构比对模型的处理主要结果SoyDNGP在大豆基因组预测中展现了出色的能力大豆基因组预测中SoyDNGP与其他算法的性能比较SoyDNGP模型在不同大豆群体中的多功能预测能力SoyDNGP 在大豆之外的广泛应用SoyDNGP是一个面向大豆基因组预测的开放友好 ......
基因组选择中的SVM
支持向量机（Support Vector Machines, SVM）是一种广泛应用于分类和回归问题的监督学习方法。在基因组选择（Genomic Selection, GS）的背景下，SVM主要用于二分类或回归问题，目的是预测个体的遗传潜力。 SVM的基本原理： SVM试图找到一个超平面，这个超平面 ......
全基因组选择中的p>n
当独立变量（或特征）的数量超过样本（或观察值）的数量时，会遇到所谓的“p > n”问题。在此，"p"指的是特征数量，而"n"指的是观察或样本数量。这里的特征可以是基因型数据中的单核苷酸多态性(SNPs)等。 以下是“p > n”问题的几个关键点： 过拟合: 当特征数量超过样本数量时，模型更容易过拟合 ......
深度学习模型在基因组选择中的预测能力（统计、总结）
Gianola et al. [61]: 应用：基因组选择。 比较：多层感知器（MLP）与贝叶斯线性回归（BRR）。 结果：在小麦数据集中，随着隐藏层神经元数量的增加，MLP的预测能力提高。MLP对BRR的性能提高了11.2%至18.6%。在Jersey数据集中，MLP也超越了BRR，特别是在脂肪产 ......
【科研03】【代码复现】TransUnet道路提取
目录1. 数据准备 data process2. 文件更名 files rename2.1. 数据更名 npz rename2.2. 文档更名 txt rename3. 代码修改 code change3.1. 目录调整 contents3.2. 数据读取 code13.2. 训练参数 parame ......
【科研02】【代码复现】【代码分享】TransUnet-RoadExtract 道路提取【数据预处理-raster2npz】
目录1. 数据处理 data process1.1. 类型转换 Raster to Png1.2. 边缘填充 Resize1.2.1. 填充 Resize image1.2.1. 填充 Resize label1.3. 批量裁剪 Clip1.4. 波段缩减 3bands to 1band1.5. 筛 ......
【科研01】【代码复现】TransUnet-文件目录安排
目录1. 信息 TransUnet1.1. 时间 open time1.2. 链接 Link github1.3. 应用 Use2. 自用 TransUnet2.1. 目录 Tree2.2. 修改 Change 1. 信息 TransUnet 1.1. 时间 open time 2021 1.2. ......
基因分型数据与碱基序列的输入
基因分型数据和碱基序列的输入都是对DNA信息的编码，但它们的表达方式和所提供的信息不同。为了理解它们之间的联系，让我们首先明确这两者的定义： 基因分型数据： 基因分型数据通常是在特定的单核苷酸位置上（即SNP位置）对个体的DNA的描述。每个SNP位置可以有三种情况：两种纯合子和一种杂合子。例如，考虑 ......
基因组数据的缺失数据的处理和标准化或归一化
基因组数据的预处理和整合至关重要，特别是当考虑到数据的不完整性、不规则性和大尺度。以下是一个全基因组选择中，如何处理基因组数据并将其输入神经网络的步骤： 1. 缺失数据处理 在基因分型过程中，可能会产生缺失数据。处理这些缺失数据的方法有很多，其中一些常见的方法是： 均值填充：使用该基因标记在所有样本 ......